Con su territorio dividido entre dos municipios de distintas provincias y muchos actores implicados en su cuidado y aprovechamiento, la gestión del Parque Natural de las Lagunas de Ruidera es un asunto complejo que no ha mejorado mucho en las últimas décadas. Enrique Calleja, presidente de la Junta Rectora, explicó que "la descoordinación entre administraciones es una de las quejas más habituales"